一、空行药叉（虚空药叉）：此种药叉神通广大，有时候是佛菩萨所化。
二、天行药叉：能在空中飞行的药叉。
三、地行药叉：在地面活动的药叉，其移动速度非常快捷。也有昼伏夜出者，或隐于山腹洞穴者。
药叉亦有男、女相的分别，男相勇猛刚强或恐怖相，女相药叉则华丽漂亮，并不见得是骂人时的「母夜叉」那样的丑恶。佛菩萨经常缘于大悲心以正定智能化现「金刚夜叉恐怖相」帮助学佛人解除烦恼障，使大精进修行。「药叉」之所以能被称为「大将」或「神将」者是因为药叉已具有金刚菩萨的果位，拥有大慈悲心和大无畏精神的行道者，功德俱足，威严自在，所以十二药叉大将能各领七千眷属，荷负有情，护持正法，遂行佛愿。
药叉别名：
一、贵人：药叉能自富贵，复令人富贵，使人居上位、即（人）之意。在民间信仰上为求显达，故祀奉药叉神祇极普遍。
二、遮持：药叉神咒有生善灭恶的功能，能遮持种种恶，持一切善，非常灵感神验，故又名「遮持」。
三、疾风：药叉身手佼捷，人间天上往来迅速如风，故能快速承事佛事及响应众生祈求。
四、勇健：显示药叉强壮刚猛有力，不被外力摧伏，而能拥伏一切，故佛菩萨以大悲心常现「金刚力士药叉身」救渡众生。
十二药叉神将也表药师如来十二大愿的象征，十二药叉大将能各领七千眷属，合为八万四千，开八万四千，表八万四千尘劳，人经一日一月，发八万四千念虑，是八万四千夜叉，守护一一念虑，又为八万四千金刚手者是也，入八万四千毛孔，不退守护、他们在一年十二月，每天十二时辰中，轮值守护。佛教十二药叉神将头上有生肖标志，又代表时辰，是药师如来守护众生，譬如随身影，一分未舍离、修持药师如来者，可谓：自身即药师如来，两眼日光月光尊，十二大骨十二神，八万四千毛孔鬼，一切事中利众生。（录自：大正藏图像部六，白宝口抄药师法）
十二药叉大将﹐是顺应药师如来之十二大愿而化现之羯摩神。又表十二因缘，十二大骨、在《药师本愿功德经》内十二药叉大将实时同声面佛起誓曰﹕「世尊﹗我等今者蒙佛威力，得闻世尊药师琉璃光如来名号不复更有恶趣之怖，我等相率皆同一心，乃至尽形归佛、法、僧，誓当负荷一切有情，为作义利，饶益安乐。」
